100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1492 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  336  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  99.4 
 
 
168 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  77.38 
 
 
167 aa  266  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  77.38 
 
 
167 aa  266  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  76.79 
 
 
167 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  76.79 
 
 
167 aa  265  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  77.98 
 
 
167 aa  257  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  76.73 
 
 
159 aa  253  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  81.21 
 
 
167 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4177  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  81.21 
 
 
167 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.304502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1155  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  80.54 
 
 
167 aa  246  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.63 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.66 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.34 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.54 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.93 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2588  hypothetical protein  28.24 
 
 
168 aa  61.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.92104  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.67 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.67 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.67 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  28.12 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  29.5 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.5 
 
 
175 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  28.05 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.04 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.92 
 
 
175 aa  57.4  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.44 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.57 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.44 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.53 
 
 
166 aa  54.7  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.44 
 
 
175 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  28.66 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.42 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.58 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  25 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.58 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  26.67 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.68 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.32 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.28 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.32 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.46 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.88 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.46 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.46 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.78 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  28.67 
 
 
165 aa  52  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  28.67 
 
 
165 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  28.67 
 
 
165 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.45 
 
 
165 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  27.74 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  27.74 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  27.74 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  27.74 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  27.74 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  27.74 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  27.74 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  27.74 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.79 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  24.82 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  26.16 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.39 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  27.5 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  27.5 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.55 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.83 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  25.29 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  23.78 
 
 
169 aa  48.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.87 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.09 
 
 
175 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  30.12 
 
 
171 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.59 
 
 
171 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.11 
 
 
175 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.39 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  28.57 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.03 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.32 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.09 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.47 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.57 
 
 
216 aa  44.3  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.57 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.78 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  23.35 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.2 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.95 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  24.84 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  22.67 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  22.67 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.84 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  29.75 
 
 
164 aa  40.8  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.77 
 
 
159 aa  40.8  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>