54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2998 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 175 aa  339  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  68.75 
 
 		 175 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  46.02 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  43.89 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.35 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.14 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.22 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.52 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.53 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.02 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  26.88 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.59 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  28.81 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.23 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  26.71 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  26.71 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  26.71 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  25.75 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.32 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.56 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  27.11 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  24.26 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.45 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.43 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.14 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  23.21 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  23.95 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  23.21 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.08 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  23.95 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.64 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  24.66 
 
 		 176 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.24 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.68 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.17 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0599  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.39 
 
 		 168 aa  41.2  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  31.54 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  31.54 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  31.54 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  31.54 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  31.54 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  31.54 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  31.54 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>