32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1000 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 192 aa  378  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  43.92 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03345  hypothetical protein  40.36 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.64 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.68 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1713  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.47 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.47 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0535  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  27.74 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.98 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.38 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0599  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.85 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.97 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 		 169 aa  48.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.09 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.67 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.42 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5660  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.38 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  27.47 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.26 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3211  hypothetical protein  29.63 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00229754  normal  0.155539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.07 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.49 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  24.14 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.2 
 
 		 174 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.59 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  21.21 
 
 		 190 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0120  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.26 
 
 		 152 aa  41.6  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286518  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.65 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>