23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0861 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  41.67 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5660  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.41 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1713  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.69 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  29 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_002950  PG0535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.11 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.41 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03345  hypothetical protein  30.65 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0599  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.32 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.35 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.58 
 
 		 172 aa  47.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.33 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.65 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.03 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.83 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.83 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  24 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.92 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  26.14 
 
 		 174 aa  42.4  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.21 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.77 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>