86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0192 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.59 
 
 
176 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.18 
 
 
178 aa  131  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  33.14 
 
 
206 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.47 
 
 
177 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.22 
 
 
211 aa  94.4  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.55 
 
 
341 aa  91.3  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  29.38 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.75 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.07 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.84 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.49 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.54 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  27.68 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  24.71 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.12 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.09 
 
 
364 aa  62  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.95 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.14 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.88 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.86 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  25 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  25.32 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  25.32 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  26.8 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.42 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  23.45 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  26.75 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.68 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.11 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.07 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.43 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.3 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.92 
 
 
193 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.92 
 
 
193 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.11 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  25.14 
 
 
213 aa  51.2  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  21.95 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.41 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.26 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  26.4 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.21 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.82 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  23.78 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.57 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.71 
 
 
175 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.43 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.71 
 
 
175 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  26.21 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  26.21 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  26.21 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  25.17 
 
 
176 aa  47.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.13 
 
 
188 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.66 
 
 
165 aa  47.8  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.12 
 
 
175 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  26.04 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  23.08 
 
 
178 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 
178 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  26.04 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  26.61 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  26.23 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  24.55 
 
 
172 aa  45.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.12 
 
 
175 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.15 
 
 
176 aa  44.7  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.4 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.93 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  25.73 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  22 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.85 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.56 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.56 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.14 
 
 
195 aa  42.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.38 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.56 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  22.49 
 
 
175 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.91 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.23 
 
 
230 aa  41.2  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>