46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4389 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  61.4 
 
 		 190 aa  223  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  41.9 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.79 
 
 		 176 aa  141  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.11 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.71 
 
 		 341 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  35.33 
 
 		 275 aa  105  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.36 
 
 		 177 aa  104  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  27.22 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.56 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  23.81 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  25.3 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.82 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.65 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.77 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.4 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.28 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  26.63 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.87 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.94 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.57 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.17 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  25.26 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  27.22 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  20.67 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  22.91 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  25.77 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.75 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.67 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.49 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1957  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.396318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.67 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.13 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  17.2 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.6 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  29.34 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.51 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.51 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  22.45 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.45 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.75 
 
 		 173 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.43 
 
 		 192 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.76 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>