35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1689 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 341 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  45.72 
 
 		 275 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.59 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  41.86 
 
 		 178 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.71 
 
 		 211 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  34.83 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.5 
 
 		 176 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.12 
 
 		 190 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.01 
 
 		 177 aa  95.9  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  31.55 
 
 		 174 aa  90.5  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  24.85 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.55 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.42 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.35 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  29.14 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 		 173 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 		 166 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 		 184 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.49 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.67 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.17 
 
 		 178 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  26.17 
 
 		 178 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  24.57 
 
 		 171 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.57 
 
 		 179 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 		 187 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  23.89 
 
 		 216 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  28.57 
 
 		 181 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0716  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.86 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.239683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.47 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.73 
 
 		 171 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.55 
 
 		 177 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.42 
 
 		 174 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.45 
 
 		 183 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  26.45 
 
 		 184 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>