98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1448 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  100 
 
 		 181 aa  359  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  61.88 
 
 		 182 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  55 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  49.15 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  44.44 
 
 		 196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  45.88 
 
 		 196 aa  157  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.58 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.05 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  28.48 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  28.25 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  27.65 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  21.95 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  25.88 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  25.88 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.74 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  28.98 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  27.22 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  28.39 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.76 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.49 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.97 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  23.39 
 
 		 213 aa  51.2  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  25 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.4 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 		 188 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.4 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.99 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.4 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.84 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  25.14 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  28.48 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  25.14 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  28.48 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  28.48 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.84 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.62 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  24.43 
 
 		 171 aa  48.5  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.73 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  29.75 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.81 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.64 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.57 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.97 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.72 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  29.11 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.43 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  24.85 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.39 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2588  hypothetical protein  28.65 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.92104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  28.17 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.31 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.04 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.49 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.6 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.22 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.22 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.65 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.85 
 
 		 177 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.75 
 
 		 211 aa  44.3  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.85 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  25.85 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.85 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  25.85 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.85 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.85 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.85 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.53 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  28.98 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.4 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.4 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.71 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  27.21 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  23.65 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.41 
 
 		 165 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  25.45 
 
 		 168 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  25 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.84 
 
 		 168 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.84 
 
 		 165 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.84 
 
 		 165 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.84 
 
 		 165 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  24.57 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.39 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.83 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>