35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2588 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2588  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  338  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.92104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  27.38 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  28.24 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.22 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  25.73 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1155  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.45 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.45 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4177  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.45 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.304502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  22.73 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.71 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  23.35 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.14 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.06 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1281  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.78 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.986683  normal  0.632442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  23.39 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  28.99 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  26.79 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  26.79 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.44 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.27 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.27 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.27 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  26.51 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  26.51 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.4 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  25.42 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.42 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.42 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.42 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.42 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.82 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  27.22 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.15 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.94 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>