76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38900 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  100 
 
 		 167 aa  332  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  87.43 
 
 		 167 aa  298  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  82.63 
 
 		 167 aa  278  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  81.44 
 
 		 167 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  85.03 
 
 		 167 aa  274  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  77.38 
 
 		 168 aa  266  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  77.38 
 
 		 168 aa  266  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1155  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  84.43 
 
 		 167 aa  266  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  83.83 
 
 		 167 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4177  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  83.83 
 
 		 167 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.304502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  79.87 
 
 		 159 aa  260  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.43 
 
 		 165 aa  87.4  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.54 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  28.82 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.22 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.74 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.38 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.26 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.4 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  26.8 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.88 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.68 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.22 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.22 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.22 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.78 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  28.78 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  26.44 
 
 		 171 aa  50.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.93 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  30.64 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  25.68 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2588  hypothetical protein  23.39 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.92104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.1 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.6 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.56 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.33 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.33 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.25 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.12 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.28 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  22.88 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.64 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  28.93 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  25.48 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.98 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  25.48 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  25 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  24.11 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.35 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.35 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.35 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  20.92 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  20.92 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  20.92 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.05 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  23.78 
 
 		 165 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  23.78 
 
 		 165 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  23.78 
 
 		 165 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  25.85 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  23.03 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.11 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.49 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.03 
 
 		 216 aa  40.8  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>