80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1371 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  100 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  49.43 
 
 		 175 aa  178  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  46.02 
 
 		 175 aa  164  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.59 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.74 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.03 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.05 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.31 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  28.11 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.6 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.44 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.57 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.74 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.61 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.56 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.82 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.18 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.18 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.18 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.38 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.67 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.38 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.63 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.29 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.29 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  25.87 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.49 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  27.63 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.56 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.56 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.56 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.07 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.62 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  24.85 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  30.82 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.9 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.15 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.62 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.58 
 
 		 167 aa  51.2  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  25.9 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.18 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.18 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.18 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.18 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  25.18 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  25.18 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.18 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  29.21 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.05 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.48 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.92 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.71 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.09 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.41 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  22.67 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  22.09 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  23.3 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  22.67 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  26.97 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.87 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  22.35 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.1 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  22.35 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  25.16 
 
 		 171 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.84 
 
 		 341 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.82 
 
 		 214 aa  41.2  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  23.53 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>