52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4390 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  50.53 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  33.98 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  34.12 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  34.05 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.66 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.53 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.54 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.45 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.19 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  24.86 
 
 		 177 aa  62  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.86 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  35 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.25 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.77 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  27.56 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.99 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  32.24 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.41 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  24.68 
 
 		 174 aa  52.4  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.47 
 
 		 364 aa  51.6  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.18 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  26.98 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1957  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.01 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.396318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  24.59 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.18 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0780  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.59 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230536  normal  0.263153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.59 
 
 		 175 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.78 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  25 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.21 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.44 
 
 		 166 aa  48.9  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.11 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.73 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.43 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.35 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  20.33 
 
 		 275 aa  45.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.38 
 
 		 172 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  21.18 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  20.98 
 
 		 172 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.15 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>