105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1957 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1957  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
187 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.396318  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  29.41 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  31.25 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.01 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.12 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  30.41 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  27.11 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  27.11 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  27.53 
 
 
213 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.48 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.66 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.66 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.61 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  27.59 
 
 
163 aa  58.2  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  26.44 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.29 
 
 
184 aa  54.7  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.4 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.12 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.5 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  29.05 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.4 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.86 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.21 
 
 
174 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.14 
 
 
196 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
169 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.08 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.65 
 
 
180 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  21.82 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.59 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.59 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.59 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  27.7 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.59 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.59 
 
 
341 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.53 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05165  hypothetical protein  27.93 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  26.8 
 
 
165 aa  48.5  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  25.84 
 
 
181 aa  47.8  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  24.55 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  28.57 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.74 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.85 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.34 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 
175 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.04 
 
 
165 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.65 
 
 
193 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.65 
 
 
193 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  26.17 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.22 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.65 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.61 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.74 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.61 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  24.83 
 
 
169 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.15 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  26.89 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  22.16 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  22.16 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  26.89 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  26.89 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.71 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.74 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  24.68 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.79 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  28.57 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 
165 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 
165 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 
165 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  25.95 
 
 
164 aa  44.7  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.71 
 
 
175 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.87 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  24.71 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1258  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.09 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.53 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.87 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.87 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  25.87 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.87 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.87 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  25.87 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  25.87 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.87 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1281  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.25 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.986683  normal  0.632442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  22.41 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17650  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.72 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  22.67 
 
 
275 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.83 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.26 
 
 
175 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.08 
 
 
176 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  25.95 
 
 
161 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  25.95 
 
 
161 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.4974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0251  periplasmic chaperone  25.95 
 
 
161 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.963542  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0266  periplasmic chaperone  25.95 
 
 
161 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000300705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>