42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4435 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  60.11 
 
 		 211 aa  228  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  47.16 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.57 
 
 		 176 aa  134  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.6 
 
 		 178 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.12 
 
 		 341 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.21 
 
 		 177 aa  99.4  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  31.82 
 
 		 275 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  25.9 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.16 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.57 
 
 		 364 aa  64.7  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.92 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.09 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.47 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.93 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.93 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.21 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.43 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.16 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.09 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.71 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.75 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  23.28 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.54 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.89 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.38 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  23.35 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  22.73 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.38 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  29.03 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.69 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  23.53 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.61 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.03 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0780  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.73 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230536  normal  0.263153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  25.75 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.32 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>