20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1358 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 364 aa  704    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  47.78 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  39.53 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.03 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  33.53 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.21 
 
 		 176 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.46 
 
 		 178 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.52 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.89 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  26.09 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.32 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 175 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 177 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 		 173 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  26.19 
 
 		 172 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.59 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  26.49 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.49 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  23.11 
 
 		 1682 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>