49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3746 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 177 aa  353  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.49 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.57 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.51 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.73 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.82 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.01 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.3 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.17 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 214 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.02 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 364 aa  52  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  22.02 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.59 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.97 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  25.17 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.53 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.67 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.34 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.18 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.67 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.55 
 
 		 341 aa  44.3  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  30.85 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  23.64 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.86 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.16 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.88 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  21.51 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  21.51 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03345  hypothetical protein  22.29 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.71 
 
 		 182 aa  42  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.58 
 
 		 184 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  18.49 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  19.46 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.77 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.12 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  21.48 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>