20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2449 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 172 aa  350  5.9999999999999994e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.08 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.47 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.47 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.86 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.86 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.28 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.4 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  24.57 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.38 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.01 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.71 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.71 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2868  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.5 
 
 		 245 aa  50.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.07447  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.14 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.4 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.86 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.67 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>