55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0608 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.07 
 
 		 175 aa  150  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  42.78 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  36.72 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.07 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.53 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.26 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  29.49 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  25.58 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.74 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  29.17 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  29.17 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  30 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  29.17 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.05 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.51 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.23 
 
 		 173 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.53 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.29 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0251  periplasmic chaperone  30.19 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.963542  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  30.19 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.4974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  30.19 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0266  periplasmic chaperone  30.19 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000300705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0247  periplasmic chaperone  30.19 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103395  normal  0.490215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  26.09 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.43 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.55 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.13 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.45 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.78 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  28.4 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.03 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.04 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  26.26 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.04 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  30.43 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1595  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1787  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000149194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.73 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  30.25 
 
 		 168 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  26.79 
 
 		 168 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  24.39 
 
 		 174 aa  42  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.67 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.22 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  21.97 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  21.97 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.71 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.41 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.93 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>