76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0312 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 185 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  60.11 
 
 		 182 aa  228  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  58.92 
 
 		 187 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  55.49 
 
 		 196 aa  208  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  55 
 
 		 181 aa  198  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  47.8 
 
 		 196 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.86 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  27.22 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  26.53 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.64 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.17 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.06 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  25.15 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.18 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.31 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.28 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.75 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.36 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.26 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.1 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.45 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  26.85 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.33 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.33 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.21 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  25 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  26.01 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.89 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  27.35 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  20.41 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  25.74 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  27.74 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.3 
 
 		 168 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.32 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  25 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  28.8 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  25 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.14 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  27.37 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  24.29 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  26.38 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.16 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  26.26 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  27.22 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  24.64 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  24.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  24.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.87 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.29 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  24.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.82 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.16 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.35 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  24.71 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.11 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.19 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.39 
 
 		 171 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  25.6 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  27.22 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  24.71 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.49 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>