17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0716 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0716  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 158 aa  307  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.239683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0715  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  42.57 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.27 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1290  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.77 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382466  normal  0.245973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.5 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1291  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.171766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.44 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.86 
 
 		 341 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  30.65 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  30.65 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  30.65 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.91 
 
 		 196 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  27.1 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.39 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  28.74 
 
 		 196 aa  40.8  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.49 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>