22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1290 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1290  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382466  normal  0.245973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  49.04 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1291  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  55.41 
 
 		 155 aa  158  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.171766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  47.71 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0715  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.03 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0716  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.239683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.57 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  25.15 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  25.15 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  27.49 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.88 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  27.61 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0595  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.84 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  26.74 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1698  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.32 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  25 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.72 
 
 		 159 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.71 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.6 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.83 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  26.51 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>