42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1755 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 159 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1698  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  93.08 
 
 		 159 aa  276  6e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0595  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.71 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0839  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.61 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0089  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.21 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.17 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0120  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286518  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.79 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.56 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.72 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.86 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.54 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.54 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  22.5 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.71 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  23.87 
 
 		 169 aa  43.9  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  20.12 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.35 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  29.48 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  23.23 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  29.48 
 
 		 167 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 171 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.56 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  30.77 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.16 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  21.34 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1290  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.86 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382466  normal  0.245973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.68 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  30.77 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4177  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.68 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.304502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.42 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  27.07 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.09 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  25.99 
 
 		 275 aa  40.8  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1155  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.63 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>