15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0715 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0715  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 179 aa  350  7e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1290  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.5 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382466  normal  0.245973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.97 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.09 
 
 		 162 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0716  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  42.68 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.239683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1291  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.171766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.37 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.33 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.21 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.47 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  23.02 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.29 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  25.29 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.66 
 
 		 169 aa  42  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>