27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3548 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 221 aa  427  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0476  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  46.58 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0013663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.91 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.61 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.84 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2125  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.73 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.25 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.2 
 
 		 175 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  29.09 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.59 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.33 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  30 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.41 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.13 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.69 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.86 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.66 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  24.66 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.38 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.94 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.7 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.83 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.63 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.45 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>