25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2125 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2125  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 223 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  76.34 
 
 		 224 aa  294  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.21 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.3 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.28 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0476  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.55 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0013663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.49 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.78 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  23.65 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.65 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.65 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  24.1 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.53 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.54 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  27.03 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.88 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.5 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.78 
 
 		 171 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.03 
 
 		 171 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.03 
 
 		 171 aa  51.6  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.43 
 
 		 177 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.52 
 
 		 175 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.97 
 
 		 193 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.97 
 
 		 193 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>