15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0405 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0405  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.490313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.03 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.87 
 
 		 171 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.34 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.26 
 
 		 164 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  27.68 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.74 
 
 		 165 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  23.17 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.69 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.41 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.43 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.43 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.43 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.43 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.43 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>