More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4932 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4932  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4236  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1795  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5454  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.25 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  27.97 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.54 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  26.54 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  28.04 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.54 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.54 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.54 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3634  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6637  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.252067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.54 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.92 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  26.15 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 322 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 329 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.14 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1758  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068602  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.15 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  23.53 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.62 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2081  transcriptional regulator, LysR family  29.5 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000034  transcriptional regulator LysR family protein  26.26 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000511263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  26.58 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  23.53 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  23.53 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  23.53 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.6 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  23.14 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  23.14 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  23.14 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1880  transcription regulator protein  29.73 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.71 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4408  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 344 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.830984  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  25.45 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  25.39 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  23.94 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.44 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  23.53 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6967  transcriptional regulator, LysR family  25.48 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.44 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.3 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.3 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.3 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.44 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.3 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.52 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.52 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18480  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1450  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 349 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308203  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0668  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0273303  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.3 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6292  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8322  transcriptional regulator LysR family  22.81 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489992  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0094  LysR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  23.75 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>