117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0129 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 546 aa  1078    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  35.1 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  94.41 
 
 		 148 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  23.96 
 
 		 529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  25.04 
 
 		 522 aa  113  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  24.41 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  24.31 
 
 		 508 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  26.19 
 
 		 500 aa  97.1  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 501 aa  86.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 521 aa  80.5  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  23.37 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  24.46 
 
 		 528 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 792 aa  63.9  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 473 aa  63.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 482 aa  62  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 482 aa  62  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 773 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  32.64 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  38.2 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  26.06 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  32.72 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  25.62 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 786 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  23.43 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 745 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.31 
 
 		 460 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 770 aa  54.3  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  23.8 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 514 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  23.2 
 
 		 466 aa  52.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 485 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  24.57 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 		 455 aa  51.2  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  35.79 
 
 		 641 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1223  amino acid permease-associated region  33.64 
 
 		 490 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  25.45 
 
 		 452 aa  50.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  36.11 
 
 		 466 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  31.36 
 
 		 483 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  36.11 
 
 		 466 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  19.88 
 
 		 467 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  20.7 
 
 		 467 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  23.51 
 
 		 525 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 716 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  32.04 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  20.91 
 
 		 467 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  20.91 
 
 		 467 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  22.13 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  23.16 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  24.49 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  20.91 
 
 		 467 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  20.91 
 
 		 467 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  20.91 
 
 		 467 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  21.54 
 
 		 476 aa  47.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 		 517 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  33.33 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  33.33 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  33.33 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  33.33 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  33.33 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  33.33 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  33.33 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 471 aa  47.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  24.49 
 
 		 470 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  20.91 
 
 		 467 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  33.33 
 
 		 468 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  33.33 
 
 		 467 aa  47  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 469 aa  47.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 471 aa  47  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.27 
 
 		 471 aa  47  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  20.7 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  33 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  28 
 
 		 753 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  32.69 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 463 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.27 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  24.06 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  23.94 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.27 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.79 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.27 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.27 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.27 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>