More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1121 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 490 aa  961    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2499  amino acid permease-associated region  36.83 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0687107  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  25.27 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  25.27 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.98 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  28.75 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  22.78 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  24.74 
 
 		 535 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  23.63 
 
 		 745 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  22.36 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1217  amino acid permease family protein  22.57 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0249423  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  21.31 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2130  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.345831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  27.88 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  23.42 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  23.42 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 786 aa  57.4  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 491 aa  57  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 		 544 aa  57  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  29.82 
 
 		 465 aa  57  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 773 aa  56.6  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  21.91 
 
 		 503 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  25.67 
 
 		 529 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 616 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  23.43 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 517 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.04 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  25.94 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  21.17 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  21.63 
 
 		 447 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  22.97 
 
 		 479 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  20.74 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  22.71 
 
 		 527 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  22.97 
 
 		 479 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  25.08 
 
 		 753 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.03 
 
 		 450 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 501 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  22.15 
 
 		 459 aa  53.9  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.03 
 
 		 450 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  21.8 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  21.8 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  21.8 
 
 		 458 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  24.75 
 
 		 466 aa  53.5  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  22.13 
 
 		 770 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 		 500 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.93 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  26.8 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.56 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  25.44 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  26.8 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01910  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  25.7 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  27.15 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  23.31 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  25.93 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.56 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.85 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  24.85 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  25.08 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  21.93 
 
 		 509 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  22.38 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  21.93 
 
 		 509 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.56 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  24.85 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>