28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0929 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 515 aa  1008    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  59.77 
 
 		 521 aa  602  1.0000000000000001e-171  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  59.14 
 
 		 512 aa  598  1e-170  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  46.85 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  43.44 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  42.97 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  34.3 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  35.97 
 
 		 500 aa  280  5e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 522 aa  167  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  24.39 
 
 		 528 aa  99  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 546 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  24.96 
 
 		 529 aa  86.7  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  24.09 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  37.08 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  26.47 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 487 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  29.11 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  29.11 
 
 		 462 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  29.11 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  29.11 
 
 		 462 aa  43.5  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  29.11 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  29.11 
 
 		 462 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  29.11 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>