21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0358 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 499 aa  973    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  66.13 
 
 		 506 aa  614  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  56.72 
 
 		 501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  43.36 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  44.77 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  44.4 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  33.01 
 
 		 508 aa  236  9e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  31.72 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  26.96 
 
 		 528 aa  88.6  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  25.89 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 519 aa  75.5  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  23.17 
 
 		 529 aa  54.3  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  32.99 
 
 		 148 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 534 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 773 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  24.14 
 
 		 478 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  24.14 
 
 		 478 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>