108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0540 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  100 
 
 
519 aa  1010    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 
522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 
546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  24.67 
 
 
500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  22.94 
 
 
535 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  27.08 
 
 
528 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  25.88 
 
 
529 aa  95.9  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  24.73 
 
 
512 aa  95.1  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 
521 aa  94  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  25.84 
 
 
504 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 
501 aa  87  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  23.3 
 
 
508 aa  87  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 
515 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 
499 aa  69.7  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 
534 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  31.65 
 
 
148 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25 
 
 
486 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25 
 
 
486 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 
538 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 
478 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.17 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  24.07 
 
 
483 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 
496 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.47 
 
 
462 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 
468 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  27.81 
 
 
466 aa  52  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 
500 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  27.94 
 
 
426 aa  51.6  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 
488 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 
482 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 
482 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  22.42 
 
 
491 aa  50.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  24.32 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  28.3 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  28.07 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 
490 aa  48.5  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  31.46 
 
 
506 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 
495 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  26.21 
 
 
474 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
469 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
488 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
495 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 
517 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  23.05 
 
 
501 aa  47.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 
502 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28 
 
 
495 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 
481 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0916  D-serine/D-alanine/glycine transporter  22.36 
 
 
466 aa  47  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 
491 aa  47  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.71 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  22.22 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  23.79 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  22.22 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  26.23 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 
491 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 
501 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  22.22 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  22.35 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  22.17 
 
 
483 aa  46.2  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  25 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
467 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
467 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
467 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 
497 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 
491 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  25.77 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.08 
 
 
471 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 
686 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
469 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
469 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
469 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  25.77 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 
483 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  23.56 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  23.56 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  23.56 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  23.56 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.04 
 
 
489 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.58 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.45 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  23.56 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 
471 aa  44.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  21.89 
 
 
496 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 
473 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25 
 
 
441 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  25.77 
 
 
470 aa  44.3  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 
433 aa  44.3  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.733586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>