16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0873 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1040    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  31.53 
 
 
504 aa  231  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  30.49 
 
 
522 aa  180  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  26.47 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  30.11 
 
 
500 aa  141  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 
521 aa  100  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  26.93 
 
 
529 aa  98.2  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  25.85 
 
 
512 aa  97.4  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 
515 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 
519 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 
499 aa  72  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 
544 aa  71.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 
506 aa  70.1  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 
546 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  30.77 
 
 
535 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>