31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0992 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  100 
 
 
535 aa  1050    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  35.04 
 
 
546 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 
534 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  25.45 
 
 
529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 
519 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  44.7 
 
 
148 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  25.68 
 
 
500 aa  94.4  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 
544 aa  93.2  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 
515 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  26.11 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  24.91 
 
 
508 aa  74.7  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 
490 aa  65.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  23.8 
 
 
521 aa  63.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  33.33 
 
 
512 aa  50.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 
522 aa  50.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.77 
 
 
483 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 
491 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  31.63 
 
 
528 aa  47.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  39.47 
 
 
463 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.63 
 
 
489 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.47 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.47 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  35.06 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  44.83 
 
 
430 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 
500 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  47.92 
 
 
740 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  43.64 
 
 
447 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 
517 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  25.22 
 
 
483 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 
496 aa  43.5  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>