36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4340 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  94.41 
 
 		 546 aa  272  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  44.7 
 
 		 535 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  40.37 
 
 		 544 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  38.4 
 
 		 534 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  41.11 
 
 		 500 aa  64.7  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  37.08 
 
 		 515 aa  60.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  38 
 
 		 740 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  38.04 
 
 		 501 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  34.74 
 
 		 521 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  35.96 
 
 		 508 aa  57.4  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  33.98 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  38.3 
 
 		 641 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  35.48 
 
 		 512 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  36.04 
 
 		 725 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  35.45 
 
 		 504 aa  55.1  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 522 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  37.23 
 
 		 773 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 519 aa  50.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  34.04 
 
 		 716 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  33.33 
 
 		 753 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 465 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 463 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  36 
 
 		 786 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 447 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  32.99 
 
 		 499 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  26.26 
 
 		 529 aa  41.6  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 		 820 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  26.89 
 
 		 462 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 458 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  34.94 
 
 		 447 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 455 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  31.96 
 
 		 528 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  34.67 
 
 		 745 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  34.67 
 
 		 442 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  37.93 
 
 		 420 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>