44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0205 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  100 
 
 		 500 aa  968    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  67.39 
 
 		 508 aa  673    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  35.97 
 
 		 515 aa  280  5e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  35.28 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  33.72 
 
 		 501 aa  223  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  31.72 
 
 		 499 aa  206  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  37.02 
 
 		 506 aa  177  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  29.01 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  30.11 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 522 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 		 519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 546 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  25.91 
 
 		 535 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  25.44 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  41.11 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  24.46 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  23.16 
 
 		 490 aa  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  22.03 
 
 		 740 aa  47  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  22.84 
 
 		 480 aa  47  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  23.74 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  23.97 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  23.74 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  23.74 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.27 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  22.91 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  24.36 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  34.34 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  23.74 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  23.74 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 716 aa  44.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  23.52 
 
 		 471 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  24.35 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 455 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  30.91 
 
 		 473 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  30.91 
 
 		 473 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  30.91 
 
 		 473 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  30.91 
 
 		 473 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>