18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0109 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  100 
 
 		 512 aa  1009    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  59.14 
 
 		 515 aa  598  1e-170  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  57.23 
 
 		 521 aa  592  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  44.86 
 
 		 501 aa  445  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  44.4 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  42.55 
 
 		 506 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  35.01 
 
 		 508 aa  282  9e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  35.09 
 
 		 500 aa  266  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  25.85 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  24.68 
 
 		 504 aa  97.1  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 534 aa  73.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  24.14 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  35.48 
 
 		 148 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 		 544 aa  53.5  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  27.66 
 
 		 535 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>