20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0189 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  981    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  31.53 
 
 		 528 aa  243  7e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 522 aa  207  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  29.39 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  27.64 
 
 		 508 aa  136  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 546 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  25.18 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  23.56 
 
 		 512 aa  94.7  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 519 aa  92  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  35.59 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  25.6 
 
 		 535 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  31.25 
 
 		 499 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 515 aa  57  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  35.45 
 
 		 148 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 544 aa  51.2  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 534 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 740 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>