19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0391 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  100 
 
 
529 aa  1045    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  24.78 
 
 
535 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 
546 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 
544 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  26.06 
 
 
504 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  26.87 
 
 
528 aa  100  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 
534 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 
519 aa  98.2  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 
522 aa  96.3  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 
515 aa  90.5  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 
521 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  25.81 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  26.06 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 
501 aa  70.5  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 
506 aa  68.2  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  23.49 
 
 
512 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 
490 aa  59.3  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 
499 aa  47.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  22.27 
 
 
466 aa  43.9  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>