18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0817 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  100 
 
 
506 aa  995    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  66.13 
 
 
499 aa  625  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  51.77 
 
 
501 aa  506  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  42.97 
 
 
515 aa  395  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  44.02 
 
 
521 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  42.55 
 
 
512 aa  382  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  34.15 
 
 
508 aa  228  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  33.53 
 
 
500 aa  227  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 
522 aa  123  7e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  26.84 
 
 
504 aa  106  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  24.77 
 
 
528 aa  87.8  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 
546 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 
519 aa  78.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  25.45 
 
 
529 aa  77  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 
544 aa  60.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  33.98 
 
 
148 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  21.1 
 
 
490 aa  50.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 
534 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>