237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0834 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 544 aa  1056    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 546 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  26.64 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  25.76 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 534 aa  83.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  26.34 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  25.22 
 
 		 528 aa  75.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.61 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  25.09 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.19 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.19 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  40.37 
 
 		 148 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.48 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  22.91 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 511 aa  67  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1409  cationic amino acid transporter  24.69 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  24.58 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 		 520 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  24.34 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  24.34 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 501 aa  63.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  25 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  22.6 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  24.06 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  24.15 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  35.42 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  22.35 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  22.28 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 482 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  25.29 
 
 		 525 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  25.72 
 
 		 553 aa  57  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 471 aa  57  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 471 aa  57  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.08 
 
 		 471 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 488 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1683  amino acid transporter  22.14 
 
 		 508 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 515 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1121  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0304101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  25.32 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  22.28 
 
 		 440 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 456 aa  53.9  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  22.44 
 
 		 512 aa  53.5  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 745 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 516 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.37 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  22.25 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  23.89 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  21.75 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 517 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 478 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  24.56 
 
 		 497 aa  51.6  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 473 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  24.35 
 
 		 504 aa  51.2  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.43 
 
 		 476 aa  50.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  24.25 
 
 		 466 aa  50.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>