21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1269 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  100 
 
 
501 aa  984    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  56.72 
 
 
499 aa  530  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  51.77 
 
 
506 aa  474  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  46.85 
 
 
515 aa  456  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  47.28 
 
 
521 aa  447  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  44.86 
 
 
512 aa  432  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  35.04 
 
 
508 aa  233  5e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  33.72 
 
 
500 aa  216  7e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 
522 aa  129  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  25.9 
 
 
504 aa  97.1  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  24.96 
 
 
546 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 
519 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  26.19 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 
534 aa  76.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  23.88 
 
 
529 aa  65.1  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 
544 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  38.04 
 
 
148 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  34.44 
 
 
535 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0867  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 
469 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0719  amino acid permease family protein  23.44 
 
 
469 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.544014  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 
475 aa  44.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>