23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0017 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0205  amino acid transporter, putative  67.39 
 
 		 500 aa  664    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0017  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  987    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0929  amino acid permease-associated region  34.3 
 
 		 515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0109  amino acid transporter, putative  35.01 
 
 		 512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1503  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 		 521 aa  253  7e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1269  amino acid permease-associated region  35.04 
 
 		 501 aa  233  5e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0358  amino acid permease-associated region  33.01 
 
 		 499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.762419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0817  amino acid permease-associated region  33.78 
 
 		 506 aa  209  7e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0873  hypothetical protein  26.47 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1708  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0189  hypothetical protein  27.64 
 
 		 504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.106496  normal  0.619029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0129  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 546 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0540  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0391  amino acid transporter-like protein  25.18 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0773  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0834  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4340  hypothetical protein  35.96 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0513206  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0992  hypothetical protein  38.71 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  29.3 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  22.58 
 
 		 716 aa  44.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>