155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0980 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0980  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
488 aa  1014    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.407551  hitchhiker  0.0000325424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1917  C-5 cytosine-specific DNA methylase  51.31 
 
 
535 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.92455  normal  0.374422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3654  C-5 cytosine-specific DNA methylase  49.7 
 
 
494 aa  488  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2003  C-5 cytosine-specific DNA methylase  46.96 
 
 
516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00321659  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3506  C-5 cytosine-specific DNA methylase  46.96 
 
 
516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.39459  hitchhiker  0.00149895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1961  C-5 cytosine-specific DNA methylase  46.59 
 
 
516 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0550818  normal  0.0497342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3006  prophage LambdaSo, type II DNA modification methyltransferase, putative  43.84 
 
 
557 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1740  C-5 cytosine-specific DNA methylase  42.04 
 
 
669 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.313379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2642  C-5 cytosine-specific DNA methylase  44.33 
 
 
555 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000523714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.26 
 
 
710 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1040  C-5 cytosine-specific DNA methylase  43.05 
 
 
659 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1691  C-5 cytosine-specific DNA methylase  45.15 
 
 
697 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3029  DNA cytosine methyltransferase family protein  34.55 
 
 
609 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0585199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3427  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  36.1 
 
 
594 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000565023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3699  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.94 
 
 
579 aa  260  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2843  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.73 
 
 
710 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0878273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.69 
 
 
619 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000315602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2828  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.87 
 
 
684 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.85 
 
 
668 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2449  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.88 
 
 
646 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199486  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5090  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.5 
 
 
618 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3037  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.85 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0129697  normal  0.245214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0568  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.4 
 
 
553 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0234117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5574  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.44 
 
 
496 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6268  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.16 
 
 
552 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.77 
 
 
304 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
374 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.84 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
671 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.95 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  31.75 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 
652 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.4 
 
 
687 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.42 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.42 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  32.55 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.12 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
375 aa  67  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4776  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.5 
 
 
615 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.034234 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 
438 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.23 
 
 
313 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0012  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.58 
 
 
333 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684081  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2386  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.76 
 
 
295 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0340074  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.08 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4922  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.32 
 
 
652 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 
340 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  29.1 
 
 
354 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 
500 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.6 
 
 
357 aa  59.3  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.79 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 
370 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
358 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
313 aa  58.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.48 
 
 
468 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.64 
 
 
362 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.04 
 
 
446 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  23.47 
 
 
389 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 
434 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  22.97 
 
 
308 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  23.3 
 
 
406 aa  55.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
406 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  30.3 
 
 
615 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  25.82 
 
 
319 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  27.12 
 
 
418 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
373 aa  54.3  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
320 aa  54.3  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
657 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  24.87 
 
 
390 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 
429 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  35.71 
 
 
435 aa  53.5  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0227  type II DNA modification methyltransferase, putative  26.78 
 
 
305 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  26.98 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0255  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.04 
 
 
331 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.111291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  24.31 
 
 
489 aa  53.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25.74 
 
 
465 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  24.22 
 
 
313 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  24.64 
 
 
366 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  25.63 
 
 
440 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
317 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  24.87 
 
 
364 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  26.04 
 
 
437 aa  51.2  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.51 
 
 
320 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  31.46 
 
 
342 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
310 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  26.19 
 
 
318 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  25.14 
 
 
349 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  22.64 
 
 
689 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4845  hypothetical protein  31.06 
 
 
505 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.033259 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  25.27 
 
 
438 aa  51.2  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>