294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl308 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  100 
 
 
404 aa  820    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  44.69 
 
 
407 aa  338  9e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  46.34 
 
 
435 aa  316  6e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.7 
 
 
424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  40.62 
 
 
423 aa  282  9e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  32.59 
 
 
449 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 
318 aa  123  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  37.99 
 
 
324 aa  116  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.23 
 
 
328 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
413 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24.74 
 
 
331 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.87 
 
 
451 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.95 
 
 
313 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  31.32 
 
 
727 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  36.41 
 
 
460 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  36.41 
 
 
460 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  25.31 
 
 
328 aa  100  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 
490 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  29.76 
 
 
329 aa  99.8  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.77 
 
 
283 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  33.14 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  35.96 
 
 
305 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 
426 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.3 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  34.04 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
425 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
338 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  32.56 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  35.68 
 
 
348 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  35.03 
 
 
320 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  36.31 
 
 
427 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  32.98 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  35.94 
 
 
483 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  30.9 
 
 
311 aa  92.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  27.87 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.98 
 
 
313 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  25.53 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  24.34 
 
 
417 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  32.14 
 
 
657 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32.96 
 
 
319 aa  88.6  2e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  24.07 
 
 
352 aa  88.2  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  30.6 
 
 
315 aa  87.4  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  28.04 
 
 
438 aa  87  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 
416 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 
416 aa  86.3  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  25.71 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  28.96 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.22 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  31.35 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  23.85 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.9 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 
456 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  32.57 
 
 
495 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  29.41 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  29.36 
 
 
456 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.56 
 
 
489 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  31.98 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  31.52 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  32.77 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.26 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.42 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  23.11 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 
472 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.34 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  25.45 
 
 
472 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  24.64 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  25.45 
 
 
472 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  25.45 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  25.45 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  31.43 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  26.73 
 
 
491 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  26.07 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  31.43 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  25.45 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  25.45 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.46 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  25.93 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  25 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  25 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  25 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  25.56 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  25 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>