More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2695 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
320 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  71.2 
 
 
336 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  54.37 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.56 
 
 
328 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  37.77 
 
 
338 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  40.26 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  41.35 
 
 
324 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  38.34 
 
 
329 aa  209  7e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  40.39 
 
 
416 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  37.69 
 
 
416 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  37.61 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  36.99 
 
 
727 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  38.12 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  36.65 
 
 
331 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  38.87 
 
 
419 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  37.22 
 
 
417 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  38.49 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  35.59 
 
 
428 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  36.73 
 
 
426 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  48.15 
 
 
438 aa  179  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  37.11 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  35.84 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  36.71 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  36.53 
 
 
323 aa  169  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  37.46 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  35.91 
 
 
406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  33.24 
 
 
424 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  35.8 
 
 
657 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  48.89 
 
 
417 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.88 
 
 
418 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  35.42 
 
 
425 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  32.92 
 
 
329 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.93 
 
 
350 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  33.72 
 
 
348 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  31.33 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  40.59 
 
 
437 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 
456 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 
456 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  43.43 
 
 
460 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  43.43 
 
 
460 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  37.44 
 
 
467 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.03 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  30.32 
 
 
350 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  43.1 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.76 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  30.87 
 
 
491 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  33.14 
 
 
487 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  31.5 
 
 
323 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
423 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
423 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  31.1 
 
 
474 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  32.29 
 
 
447 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  42.26 
 
 
413 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  29.41 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  34.56 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  32.03 
 
 
476 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  32.03 
 
 
476 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  32.03 
 
 
476 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  32.03 
 
 
476 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  32.03 
 
 
476 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.91 
 
 
368 aa  126  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.57 
 
 
310 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  30.13 
 
 
373 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  32.23 
 
 
472 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.67 
 
 
313 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
328 aa  122  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  34.17 
 
 
444 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.63 
 
 
435 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
335 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  38.54 
 
 
472 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  38.54 
 
 
472 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  38.54 
 
 
472 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  39.42 
 
 
472 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  39.42 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  38.54 
 
 
472 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.81 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  30.55 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  26.79 
 
 
495 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  29.02 
 
 
427 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.36 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.91 
 
 
362 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
337 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
321 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.01 
 
 
424 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.45 
 
 
350 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  26.37 
 
 
389 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 
490 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  29.06 
 
 
315 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  34.48 
 
 
483 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  29.63 
 
 
380 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  30.19 
 
 
342 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 
370 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  30.81 
 
 
423 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  30.54 
 
 
383 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>