87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2731 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2449  C-5 cytosine-specific DNA methylase  57.86 
 
 		 646 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 668 aa  1362    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1040  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.87 
 
 		 659 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2843  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.21 
 
 		 710 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0878273 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5090  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.62 
 
 		 618 aa  210  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0980  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.85 
 
 		 488 aa  209  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.407551  hitchhiker  0.0000325424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2828  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.38 
 
 		 684 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1961  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.79 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0550818  normal  0.0497342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3506  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.79 
 
 		 516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.39459  hitchhiker  0.00149895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2003  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.56 
 
 		 516 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00321659  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1917  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.12 
 
 		 535 aa  193  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.92455  normal  0.374422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.63 
 
 		 619 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000315602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1691  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.49 
 
 		 697 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3654  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.93 
 
 		 494 aa  186  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1740  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.45 
 
 		 669 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3427  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.02 
 
 		 594 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000565023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3699  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.46 
 
 		 579 aa  181  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3006  prophage LambdaSo, type II DNA modification methyltransferase, putative  29.04 
 
 		 557 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.63 
 
 		 710 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2642  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.57 
 
 		 555 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3029  DNA cytosine methyltransferase family protein  30.3 
 
 		 609 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0585199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3037  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.44 
 
 		 483 aa  94  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0129697  normal  0.245214 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.71 
 
 		 304 aa  89  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0012  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.89 
 
 		 333 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5574  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.36 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.65 
 
 		 687 aa  80.1  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4922  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.19 
 
 		 652 aa  77  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6268  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.63 
 
 		 552 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0568  C-5 cytosine-specific DNA methylase  44.79 
 
 		 553 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0234117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 		 390 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4776  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.18 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.034234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2386  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.51 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0340074  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.05 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  25.64 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 		 652 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.02 
 
 		 395 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 		 452 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 		 342 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 		 434 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.17 
 
 		 328 aa  55.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 		 424 aa  55.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.39 
 
 		 362 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  27.65 
 
 		 313 aa  54.3  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.9 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  25.93 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  25.59 
 
 		 431 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.09 
 
 		 431 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  26.42 
 
 		 423 aa  52.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  24.8 
 
 		 415 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.31 
 
 		 415 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  25.9 
 
 		 359 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.35 
 
 		 671 aa  51.6  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.96 
 
 		 313 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 		 418 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 		 418 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  23.18 
 
 		 465 aa  51.2  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1360  type II restriction-modification system DNA cytosine-specific methylase  38.75 
 
 		 78 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000045922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  29.27 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  23.64 
 
 		 412 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  25.94 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 		 308 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  24.1 
 
 		 437 aa  48.9  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 		 373 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  24.36 
 
 		 375 aa  48.5  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  22.99 
 
 		 357 aa  48.5  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  26.22 
 
 		 449 aa  48.5  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  24.5 
 
 		 362 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  27.93 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  24 
 
 		 398 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  25.79 
 
 		 355 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  25.79 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 		 438 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  24.17 
 
 		 361 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1539  DNA-cytosine methyltransferase  38.18 
 
 		 569 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  20.69 
 
 		 320 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 		 657 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  22.22 
 
 		 727 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 		 325 aa  44.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  22.4 
 
 		 489 aa  44.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  22.99 
 
 		 345 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  26.15 
 
 		 440 aa  43.9  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>