71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2828 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  69.23 
 
 		 619 aa  912    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000315602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3427  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  69.31 
 
 		 594 aa  874    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000565023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2828  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 684 aa  1410    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2843  C-5 cytosine-specific DNA methylase  85.95 
 
 		 710 aa  1230    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0878273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1740  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.57 
 
 		 669 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1917  C-5 cytosine-specific DNA methylase  45.7 
 
 		 535 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.92455  normal  0.374422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3699  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.86 
 
 		 579 aa  355  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.36 
 
 		 710 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1040  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.01 
 
 		 659 aa  353  7e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1691  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.3 
 
 		 697 aa  336  7e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3006  prophage LambdaSo, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.24 
 
 		 557 aa  329  9e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2642  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.06 
 
 		 555 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3506  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.04 
 
 		 516 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.39459  hitchhiker  0.00149895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2003  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.83 
 
 		 516 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00321659  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1961  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.61 
 
 		 516 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0550818  normal  0.0497342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3654  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.38 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0980  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.87 
 
 		 488 aa  263  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.407551  hitchhiker  0.0000325424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3029  DNA cytosine methyltransferase family protein  38.74 
 
 		 609 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0585199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2449  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.67 
 
 		 646 aa  227  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.27 
 
 		 668 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5090  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.91 
 
 		 618 aa  162  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4845  hypothetical protein  29.07 
 
 		 505 aa  91.3  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.033259 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4922  C-5 cytosine-specific DNA methylase  20.83 
 
 		 652 aa  84  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.53 
 
 		 687 aa  83.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3037  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.16 
 
 		 483 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0129697  normal  0.245214 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.42 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3545  hypothetical protein  35.9 
 
 		 105 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102579 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4776  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.06 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.034234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  25.55 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  38.1 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0012  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.66 
 
 		 333 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  23.32 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0568  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.02 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0234117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.71 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5574  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.81 
 
 		 496 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6268  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.14 
 
 		 552 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 		 671 aa  54.3  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.44 
 
 		 424 aa  54.3  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  20.27 
 
 		 390 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  40.3 
 
 		 370 aa  54.3  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  37.14 
 
 		 449 aa  53.9  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.32 
 
 		 435 aa  53.9  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2386  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.06 
 
 		 295 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0340074  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  21.67 
 
 		 308 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 		 359 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  24.42 
 
 		 365 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  22.16 
 
 		 389 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.48 
 
 		 451 aa  52.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.36 
 
 		 328 aa  51.2  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 		 373 aa  50.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  23.24 
 
 		 362 aa  50.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  24.68 
 
 		 373 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  43.48 
 
 		 423 aa  48.5  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  21.72 
 
 		 404 aa  47.4  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  24.14 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1360  type II restriction-modification system DNA cytosine-specific methylase  40.68 
 
 		 78 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000045922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 		 358 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25.2 
 
 		 310 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.83 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  41.86 
 
 		 727 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  34.48 
 
 		 305 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.38 
 
 		 362 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  35.85 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  47.62 
 
 		 490 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  32.69 
 
 		 320 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  41.46 
 
 		 437 aa  45.8  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  34.62 
 
 		 336 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  25.09 
 
 		 318 aa  44.3  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  25.23 
 
 		 371 aa  43.9  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.27 
 
 		 236 aa  43.9  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>