249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0566 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
449 aa  912    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.21 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.15 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  42.28 
 
 
423 aa  299  8e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  37.84 
 
 
407 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  32.59 
 
 
404 aa  229  7e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  24.48 
 
 
437 aa  99.8  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 
324 aa  93.6  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  35.6 
 
 
490 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
320 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.81 
 
 
328 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  29.41 
 
 
239 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  23.32 
 
 
413 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
483 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
319 aa  86.7  8e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  28.22 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.73 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  31 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  26.73 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.35 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.05 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  24.89 
 
 
320 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  30.21 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 
727 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.5 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.76 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  33 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  28.43 
 
 
323 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.6 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24.1 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  27.41 
 
 
657 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  22.56 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  27.23 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.58 
 
 
283 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  26 
 
 
336 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.43 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  29.27 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  30.54 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24513  predicted protein  33.33 
 
 
820 aa  73.2  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.558259  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  28.11 
 
 
474 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.93 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  26.27 
 
 
491 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  32.67 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  27.23 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  24.65 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  24.3 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  33.93 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
434 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
311 aa  67  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  28.04 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  26.48 
 
 
447 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  27.88 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  27.88 
 
 
476 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  27.88 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  28.7 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  27.88 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  28.7 
 
 
472 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  27.88 
 
 
476 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  28.7 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.53 
 
 
357 aa  64.7  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  28.7 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  33.79 
 
 
365 aa  64.7  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  28.7 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  27.24 
 
 
472 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  23.13 
 
 
321 aa  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl304  deoxycytosine methylase  32.46 
 
 
455 aa  63.9  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.2985e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  27.37 
 
 
364 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
488 aa  63.9  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  24.74 
 
 
340 aa  63.5  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 
399 aa  63.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  25.38 
 
 
379 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 
350 aa  63.2  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
390 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>