104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3699 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3699  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 579 aa  1177    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.5 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000315602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2828  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.18 
 
 		 684 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2843  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.35 
 
 		 710 aa  350  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0878273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1917  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.03 
 
 		 535 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.92455  normal  0.374422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3427  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  37.69 
 
 		 594 aa  326  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000565023  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3654  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.38 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3006  prophage LambdaSo, type II DNA modification methyltransferase, putative  34.81 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2642  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.34 
 
 		 555 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2003  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.22 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00321659  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3506  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.39 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.39459  hitchhiker  0.00149895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1961  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.62 
 
 		 516 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0550818  normal  0.0497342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1740  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.64 
 
 		 669 aa  273  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313379 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0980  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.94 
 
 		 488 aa  260  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.407551  hitchhiker  0.0000325424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.37 
 
 		 710 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1691  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.3 
 
 		 697 aa  246  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1040  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.46 
 
 		 659 aa  239  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3029  DNA cytosine methyltransferase family protein  31.46 
 
 		 609 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0585199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.46 
 
 		 668 aa  181  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2449  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.65 
 
 		 646 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5090  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.01 
 
 		 618 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4922  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.16 
 
 		 652 aa  99  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.37 
 
 		 304 aa  88.6  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4776  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.2 
 
 		 615 aa  83.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.034234 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.18 
 
 		 687 aa  82.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0568  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.1 
 
 		 553 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0234117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  32.02 
 
 		 671 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4845  hypothetical protein  34.65 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.033259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.34 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3037  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.87 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0129697  normal  0.245214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2386  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.32 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0340074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6268  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.82 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.13 
 
 		 415 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  26.11 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  26.07 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.63 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5574  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.62 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.41 
 
 		 357 aa  63.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  25.54 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  25.85 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  24.45 
 
 		 362 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0012  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.59 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  23.84 
 
 		 415 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.7 
 
 		 405 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  26.07 
 
 		 374 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 		 421 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 		 329 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  32.48 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 		 313 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  25.97 
 
 		 365 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  24 
 
 		 319 aa  54.3  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  22.08 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  24.62 
 
 		 395 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  23.78 
 
 		 320 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 		 452 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  23.21 
 
 		 342 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.21 
 
 		 328 aa  52.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  20.25 
 
 		 361 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  22.55 
 
 		 319 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  24.36 
 
 		 313 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 		 320 aa  51.6  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  24.17 
 
 		 437 aa  51.2  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 		 348 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 		 418 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  24.89 
 
 		 308 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 		 418 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  22.13 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  21.59 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  24.43 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  21.46 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  21.05 
 
 		 345 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  24.44 
 
 		 412 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 		 361 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 		 446 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 		 418 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 		 657 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  25.43 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  24.5 
 
 		 318 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  23.08 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  22.6 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  22.54 
 
 		 355 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  25.56 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 		 423 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.88 
 
 		 435 aa  45.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  25.98 
 
 		 438 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  22.12 
 
 		 349 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  22.92 
 
 		 689 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  27.83 
 
 		 440 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  27.83 
 
 		 440 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1360  type II restriction-modification system DNA cytosine-specific methylase  34.72 
 
 		 78 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000045922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>